В таблице для каждого аллеля указана его средняя частота (q) и межпопуляционное разнообразие (GST) в каждом из четырех субрегионов Северной Евразии.
Скачать файл "Classical markers in regions of Northern Eurasia.xls"
При использовании материалов ссылка на сайт www.genofond.ru обязательна.
Частоты в субрегионах рассчитаны в среднем по этносам, входящим в субрегион (расчет с иерархией “популяция>1 - этнос - субрегион”). Частоты для Северной Евразии рассчитаны как средние по субрегионам (с иерархией “популяция>1 - этнос - линг.ветвь - лингв.семья - субрегион – С. Евразия”). Двуаллельные локусы выделены цветом.
Регион
СЕВЕРНАЯ ЕВРАЗИЯ
СИБИРЬ
УРАЛ
СРЕДНЯЯ АЗИЯ
КАВКАЗ
ВОСТОЧНАЯ ЕВРОПА
Аллель
`q
FST
ABO*A
0.234
2.66
0.209
4.03
0.207
1.36
0.255
2.67
0.236
2.05
0.256
2.03
ABO*B
0.190
3.44
0.180
6.12
1.65
0.228
1.78
0.137
2.19
0.167
ABO*O
0.577
3.19
0.612
5.10
0.584
1.47
0.517
2.94
0.627
1.38
ACP1*A
0.307
3.90
0.372
8.83
0.320
1.29
0.277
0.90
0.314
0.83
0.298
2.65
ACP1*B
0.670
3.92
0.623
8.63
0.644
1.81
0.719
1.05
0.76
0.654
2.18
ACP1*C
0.019
2.97
0.005
1.48
0.028
1.30
0.68
0.016
1.70
0.048
2.09
AK1*2
0.015
1.15
0.017
1.74
0.021
0.45
0.000
0.00
C3*F
0.107
3.61
0.061
4.34
0.124
2.36
0.081
0.152
1.02
CV*def
0.068
5.01
0.029
2.85
0.051
4.18
0.115
1.51
0.101
1.98
DI*A
0.057
7.44
0.102
11.37
0.011
0.111
2.62
E2*C5+
2.64
0.053
2.61
0.031
1.33
ESD*1
0.847
2.46
0.829
2.24
0.813
0.64
0.893
3.62
0.883
1.37
FUT*SE
0.371
8.51
0.280
13.43
0.291
10.79
0.410
2.59
0.487
3.28
0.378
2.37
FY*A
0.578
12.01
0.783
12.12
0.573
1.26
0.637
2.31
0.442
1.24
0.418
5.76
GC*1
0.752
3.59
0.753
7.17
0.748
0.727
1.79
0.795
1.80
0.695
1.90
G6PD*def
8.43
0.014
0.78
0.052
9.74
GLO*1
0.386
2.53
0.285
4.19
0.414
0.85
0.387
0.24
0.403
0.91
HLA*A1
0.103
3.35
6.22
0.073
3.46
0.110
0.33
0.104
0.140
1.66
HLA*A2
0.260
2.41
0.229
1.52
0.215
0.57
0.257
1.22
0.276
4.28
0.273
1.54
HLA*A3
2.39
0.071
4.11
0.157
2.76
0.56
0.127
0.87
0.139
HLA*A9
0.195
9.90
0.377
8.29
0.212
8.23
0.169
0.80
0.146
1.32
0.112
0.40
HLA*A10
2.63
0.043
2.14
0.085
0.098
0.53
0.123
2.10
HLA*A11
0.064
2.15
0.040
1.84
0.063
3.37
0.089
1.49
0.98
0.38
HLA*A28
0.038
2.32
0.026
0.077
3.78
0.033
0.65
0.035
0.16
0.034
0.46
HLA*Aw19
0.069
5.64
6.09
0.055
1.61
0.084
7.96
3.12
HLA*AX
0.119
10.90
0.100
6.73
7.45
0.173
16.11
0.147
4.73
4.99
HLA*B5
2.99
0.074
4.35
0.51
0.155
0.092
1.86
HLA*B7
0.097
4.53
4.92
0.150
2.60
0.079
3.91
0.153
0.48
HLA*B8
0.050
3.26
0.010
0.84
3.17
0.056
0.058
HLA*B12
2.28
0.036
4.51
0.060
2.55
0.54
2.40
0.61
HLA*B13
0.062
1.95
0.037
2.95
3.01
0.078
0.97
0.36
0.72
HLA*B14
0.99
0.002
0.82
0.39
0.027
0.50
0.018
HLA*B15
3.31
0.144
2.81
0.88
0.59
0.042
3.16
0.049
HLA*B16
1.94
0.012
0.37
0.024
HLA*B17
0.054
3.66
0.41
0.89
0.44
HLA*B18
2.90
0.92
1.35
0.030
0.71
0.047
3.63
0.032
HLA*B21
2.35
0.067
2.00
0.045
1.73
0.039
HLA*B22
0.023
1.04
0.58
1.00
0.93
0.025
0.60
HLA*B27
2.70
1.03
0.072
HLA*B35
2.88
2.01
0.086
0.134
4.75
0.74
HLA*B40
0.114
16.39
0.295
13.07
0.120
3.29
0.55
1.07
HLA*BX
0.149
12.51
8.42
7.04
0.241
15.68
0.161
8.35
HLA*CW1
4.52
3.94
2.54
7.02
HLA*CW2
5.39
0.090
2.75
0.03
0.118
4.00
HLA*CW3
0.165
12.95
0.416
6.76
0.136
3.03
0.126
0.075
2.42
4.56
HLA*CW4
0.088
0.059
0.116
3.96
HLA*CW5
5.95
0.007
0.23
3.05
HLA*CX
0.591
23.13
0.356
7.05
0.611
0.772
11.58
0.725
17.17
0.501
33.67
HP*1
0.323
3.33
0.274
0.296
0.398
2.20
JK*A
0.524
1.88
0.658
9.70
0.508
0.521
0.79
KEL*K
4.10
6.21
4.39
0.117
1.72
1.17
KP*A
5.93
3.95
0.013
2.83
4.78
LEW*le
0.483
0.550
14.94
0.431
0.546
8.30
0.381
5.55
0.477
4.22
LU*A
6.03
0.006
7.47
4.91
1.83
MNS*MS
7.30
0.177
14.91
0.210
0.121
0.311
3.70
1.01
MNS*Ms
3.80
0.402
7.85
0.318
5.54
0.439
0.366
2.11
0.335
MNS*NS
11.98
11.67
5.15
MNS*Ns
0.322
5.89
0.316
13.54
0.358
0.379
0.206
0.297
1.10
P*1
0.388
6.58
11.23
0.396
3.36
0.368
7.76
0.441
2.79
0.434
3.87
PGD*C
0.046
3.00
4.13
0.044
3.72
2.50
PGM1*1+
0.618
0.663
0.558
0.648
0.49
0.565
3.09
PGM1*1-
0.08
2.38
PGM1*2+
3.10
0.185
0.227
0.178
0.270
PGM1*2-
0.065
2.22
0.091
0.083
2.58
PI*M1
0.786
0.873
1.91
0.792
4.21
0.804
0.794
PI*M2
0.143
4.26
2.04
0.132
PI*M3
6.55
3.97
PI*S
0.003
0.69
1.50
0.001
0.30
PI*Z
1.21
1.41
0.008
PTC*t
0.494
0.436
8.78
0.560
3.69
0.459
5.31
0.572
RH*CDE
5.96
7.16
4.25
5.24
2.77
RH*CDe
10.24
0.385
0.422
0.343
0.357
1.34
RH*Cde
0.022
5.85
0.004
8.24
4.58
0.020
6.84
5.36
RH*cDE
8.68
0.328
8.87
0.247
6.20
0.172
RH*cDe
0.128
10.72
0.184
20.13
6.05
0.158
5.84
0.131
0.082
5.14
RH*cdE
9.49
8.76
11.72
9.18
RH*cde
12.20
10.57
0.183
10.00
5.57
0.271
3.67
0.344
2.06
TF*B01
3.20
2.45
4.89
0.20
1.16
TF*C
0.984
2.89
0.975
3.14
0.964
0.992
0.8319
0.993
1.64
0.991
1.42
TF*Dchi
0.009
3.82
4.29
1.3317
1.27