Логотип
РУС
ХудРук — д.б.н. Балановская Е.В.

Классические маркеры в субрегионах Северной Евразии

В таблице для каждого аллеля указана его средняя частота (q)  и межпопуляционное разнообразие (GST) в каждом из четырех субрегионов Северной Евразии.

Скачать файл "Classical markers in regions of Northern Eurasia.xls"


При использовании материалов ссылка на сайт www.genofond.ru обязательна.

Частоты в субрегионах рассчитаны в среднем по этносам, входящим в субрегион (расчет с иерархией “популяция>1 - этнос - субрегион”). 
Частоты для Северной Евразии рассчитаны как средние по субрегионам (с иерархией “популяция>1 - этнос - линг.ветвь - лингв.семья - субрегион – С. Евразия”). 
Двуаллельные локусы выделены цветом.

 

Регион

СЕВЕРНАЯ ЕВРАЗИЯ

СИБИРЬ

УРАЛ

СРЕДНЯЯ АЗИЯ

КАВКАЗ

ВОСТОЧНАЯ ЕВРОПА

 

Аллель

`q

FST

`q

FST

`q

FST

`q

FST

`q

FST

`q

FST

 

 ABO*A

0.234

2.66

0.209

4.03

0.207

1.36

0.255

2.67

0.236

2.05

0.256

2.03

 

 ABO*B

0.190

3.44

0.180

6.12

0.209

1.65

0.228

1.78

0.137

2.19

0.167

1.65

 

 ABO*O

0.577

3.19

0.612

5.10

0.584

1.47

0.517

2.94

0.627

3.19

0.577

1.38

 

 ACP1*A

0.307

3.90

0.372

8.83

0.320

1.29

0.277

0.90

0.314

0.83

0.298

2.65

 

 ACP1*B

0.670

3.92

0.623

8.63

0.644

1.81

0.719

1.05

0.670

0.76

0.654

2.18

 

 ACP1*C

0.019

2.97

0.005

1.48

0.028

1.30

0.005

0.68

0.016

1.70

0.048

2.09

 

 AK1*2

0.015

1.15

0.017

1.74

0.021

0.45

0.000

0.00

0.000

0.00

0.000

0.00

 

 C3*F

0.107

3.61

0.061

4.34

0.124

2.36

0.081

2.66

0.152

1.02

0.000

0.00

 

 CV*def

0.068

5.01

0.029

2.85

0.051

4.18

0.115

1.51

0.000

0.00

0.101

1.98

 

 DI*A

0.057

7.44

0.102

11.37

0.011

1.38

0.111

2.62

0.000

0.00

0.000

0.00

 

 E2*C5+

0.048

2.64

0.053

2.61

0.031

1.33

0.000

0.00

0.000

0.00

0.000

0.00

 

 ESD*1

0.847

2.46

0.829

1.78

0.847

2.24

0.813

0.64

0.893

3.62

0.883

1.37

 

 FUT*SE

0.371

8.51

0.280

13.43

0.291

10.79

0.410

2.59

0.487

3.28

0.378

2.37

 

 FY*A

0.578

12.01

0.783

12.12

0.573

1.26

0.637

2.31

0.442

1.24

0.418

5.76

 

 GC*1

0.752

3.59

0.753

7.17

0.748

1.51

0.727

1.79

0.795

1.80

0.695

1.90

 

 G6PD*def

0.019

8.43

0.000

0.00

0.000

0.00

0.014

0.78

0.052

9.74

0.000

0.00

 

 GLO*1

0.386

2.53

0.285

4.19

0.414

0.85

0.387

0.24

0.403

0.91

0.000

0.00

 

 HLA*A1

0.103

3.35

0.048

6.22

0.073

3.46

0.110

0.33

0.104

3.46

0.140

1.66

 

 HLA*A2

0.260

2.41

0.229

1.52

0.215

0.57

0.257

1.22

0.276

4.28

0.273

1.54

 

 HLA*A3

0.115

2.39

0.071

4.11

0.157

2.76

0.104

0.56

0.127

0.87

0.139

0.64

 

 HLA*A9

0.195

9.90

0.377

8.29

0.212

8.23

0.169

0.80

0.146

1.32

0.112

0.40

 

 HLA*A10

0.081

2.63

0.043

2.14

0.085

1.48

0.098

1.52

0.081

0.53

0.123

2.10

 

 HLA*A11

0.064

2.15

0.040

1.84

0.063

3.37

0.089

1.49

0.053

0.98

0.073

0.38

 

 HLA*A28

0.038

2.32

0.026

6.22

0.077

3.78

0.033

0.65

0.035

0.16

0.034

0.46

 

HLA*Aw19

0.069

5.64

0.081

6.09

0.055

1.61

0.084

7.96

0.064

3.12

0.052

1.37

 

 HLA*AX

0.119

10.90

0.100

6.73

0.063

7.45

0.173

16.11

0.147

4.73

0.077

4.99

 

 HLA*B5

0.115

2.99

0.073

1.90

0.074

4.35

0.152

0.51

0.155

2.03

0.092

1.86

 

 HLA*B7

0.097

4.53

0.043

4.92

0.150

2.60

0.081

2.24

0.079

3.91

0.153

0.48

 

 HLA*B8

0.050

3.26

0.010

0.84

0.040

3.17

0.056

1.98

0.058

3.28

0.084

0.84

 

 HLA*B12

0.069

2.28

0.036

4.51

0.060

2.55

0.053

0.54

0.092

2.40

0.101

0.61

 

 HLA*B13

0.062

1.95

0.037

2.95

0.081

3.01

0.078

0.97

0.050

0.36

0.079

0.72

 

 HLA*B14

0.017

0.99

0.002

0.82

0.021

0.39

0.027

0.38

0.021

0.50

0.018

0.80

 

 HLA*B15

0.057

3.31

0.144

2.81

0.033

0.88

0.048

0.59

0.042

3.16

0.049

0.76

 

 HLA*B16

0.029

1.94

0.012

3.62

0.042

0.37

0.051

1.47

0.028

0.46

0.024

2.05

 

 HLA*B17

0.054

2.85

0.077

3.66

0.031

0.41

0.061

0.89

0.028

0.44

0.052

0.72

 

 HLA*B18

0.028

2.90

0.005

0.92

0.028

1.35

0.030

0.71

0.047

3.63

0.032

2.97

 

 HLA*B21

0.037

2.35

0.017

2.63

0.067

2.00

0.045

1.73

0.039

1.79

0.019

0.16

 

 HLA*B22

0.023

1.04

0.014

0.89

0.019

0.58

0.024

1.00

0.031

0.93

0.025

0.60

 

 HLA*B27

0.047

2.70

0.055

2.97

0.060

3.44

0.021

0.89

0.028

1.03

0.072

0.68

 

 HLA*B35

0.089

2.88

0.053

2.01

0.103

1.02

0.086

0.54

0.134

4.75

0.074

0.74

 

 HLA*B40

0.114

16.39

0.295

13.07

0.120

3.29

0.052

0.91

0.023

0.55

0.061

1.07

 

 HLA*BX

0.149

12.51

0.146

8.42

0.071

7.04

0.241

15.68

0.161

8.35

0.086

3.19

 

 HLA*CW1

0.050

4.52

0.035

3.94

0.047

1.07

0.036

2.54

 

 

0.074

7.02

 

 HLA*CW2

0.077

5.39

0.090

6.12

0.077

3.92

0.060

2.75

0.031

0.03

0.118

4.00

 

 HLA*CW3

0.165

12.95

0.416

6.76

0.136

3.03

0.126

0.57

0.075

2.42

0.107

4.56

 

 HLA*CW4

0.088

3.44

0.081

3.19

0.126

2.19

0.056

0.83

0.059

1.73

0.116

3.96

 

 HLA*CW5

0.027

5.95

0.007

0.80

0.007

1.48

0.014

0.23

 

 

0.081

3.05

 

 HLA*CX

0.591

23.13

0.356

7.05

0.611

0.39

0.772

11.58

0.725

17.17

0.501

33.67

 

 HP*1

0.323

2.70

0.295

3.33

0.356

2.01

0.274

0.87

0.296

1.65

0.398

2.20

 

 JK*A

0.524

1.88

0.658

9.70

0.508

1.15

 

 

0.521

0.79

 

 

 

 KEL*K

0.058

4.10

0.037

6.21

0.023

4.39

0.117

0.37

0.058

1.72

0.050

1.17

 

 KP*A

0.039

5.93

0.031

3.95

0.013

2.83

 

 

0.084

4.78

 

 

 

LEW*le

0.483

8.43

0.550

14.94

0.431

4.75

0.546

8.30

0.381

5.55

0.477

4.22

 

 LU*A

0.057

6.03

0.006

0.55

0.062

7.47

0.098

4.91

0.085

1.83

0.043

0.72

 

 MNS*MS

0.212

7.30

0.177

14.91

0.210

3.31

0.121

0.80

0.311

3.70

0.291

1.01

 

 MNS*Ms

0.381

3.80

0.402

7.85

0.318

5.54

0.439

0.45

0.366

2.11

0.335

0.60

 

 MNS*NS

0.085

7.44

0.104

11.98

0.114

11.67

0.061

0.38

0.116

1.86

0.077

5.15

 

 MNS*Ns

0.322

5.89

0.316

13.54

0.358

3.12

0.379

0.64

0.206

1.80

0.297

1.10

 

 P*1

0.388

6.58

0.291

11.23

0.396

3.36

0.368

7.76

0.441

2.79

0.434

3.87

 

 PGD*C 

0.046

3.00

0.055

4.13

0.044

2.18

0.047

3.72

0.048

2.50

 

 

 

 PGM1*1+

0.618

2.94

0.663

0.79

0.558

1.78

0.648

0.49

0.565

3.09

 

 

 

 PGM1*1-

0.101

1.07

0.116

0.08

0.123

1.17

0.092

0.61

0.100

2.38

 

 

 

 PGM1*2+

0.215

3.10

0.185

0.56

0.227

2.53

0.178

1.04

0.270

3.16

 

 

 

 PGM1*2-

0.065

2.22

0.037

0.59

0.091

1.65

0.083

1.03

0.065

2.58

 

 

 

 PI*M1

0.786

3.35

0.873

1.91

0.792

4.21

0.804

2.75

0.794

2.67

 

 

 

 PI*M2

0.143

2.03

0.078

4.26

0.136

2.04

0.132

2.65

0.155

3.00

 

 

 

 PI*M3

0.059

4.53

0.029

0.39

0.059

6.55

0.056

3.97

0.037

1.17

 

 

 

 PI*S

0.003

0.69

0.005

0.74

0.005

1.50

0.001

0.30

0.003

0.49

 

 

 

 PI*Z

0.007

1.21

0.000

0.00

0.007

1.41

0.006

0.44

0.008

1.37

 

 

 

 PTC*t

0.494

6.12

0.436

8.78

0.560

3.69

0.459

5.31

0.501

0.71

0.572

3.37

 

 RH*CDE

0.030

5.96

0.062

7.16

0.023

4.25

0.019

2.22

0.046

5.24

0.024

2.77

 

 RH*CDe

0.388

2.88

0.396

10.24

0.385

2.83

0.422

0.37

0.343

2.04

0.357

1.34

 

 RH*Cde

0.022

5.85

0.004

8.24

0.017

4.58

0.013

5.10

0.020

6.84

0.044

5.36

 

 RH*cDE

0.236

8.68

0.328

8.87

0.247

6.20

0.274

1.29

0.172

2.62

0.137

1.52

 

 RH*cDe

0.128

10.72

0.184

20.13

0.132

6.05

0.158

5.84

0.131

4.51

0.082

5.14

 

 RH*cdE

0.019

9.49

0.002

8.76

0.013

4.39

0.040

11.72

0.017

9.18

0.012

2.03

 

 RH*cde

0.177

12.20

0.025

10.57

0.183

10.00

0.075

5.57

0.271

3.67

0.344

2.06

 

 TF*B01

0.006

3.20

0.013

2.45

0.017

4.89

0.001

0.20

0.001

1.16

0.005

1.22

 

 TF*C

0.984

2.89

0.975

3.14

0.964

2.46

0.992

0.8319

0.993

1.64

0.991

1.42

 

 TF*Dchi

0.009

3.82

0.008

4.29

0.022

1.84

0.007

1.3317

0.003

1.27

0.002

1.37

  • На главную
  • Карта сайта
  • Написать письмо